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| 产地 | 上海 |
| 保存条件 | 密封于-20oC阴凉干燥环境。 |
| 品牌 | DUMABIO |
| 货号 | 电询 |
| 用途 | 科研与实验 |
| 检测方法 | 电询 |
| 保质期 | 2年 |
| 适应物种 | 电询 |
| 检测限 | 电询 |
| 数量 | 1000 |
| 包装规格 | 1mg |
| 标记物 | 无 |
| 样本 | 电询 |
| 应用 | 科研试剂 |
| 是否进口 | 否 |
推荐:Ec Uracil DNA glycosylase(UDG)说明书
E. coli Uracil N-Glycosylase (UNG),即大肠杆菌UDG或UNG,可催化含尿嘧啶的DNA链中的尿嘧啶(dU)碱基和脱氧核糖之间的N-糖苷键发生水解,从而释放游离尿嘧啶。Uracil-DNA Glycosylase (UDG)可以水解含有dU的单链或双链DNA,但不能水解RNA或含有dU的长度不超过6个碱基DNA寡聚体。
UDG主要应用于消除PCR扩增过程中带来的产物污染问题。其防止污染的原理为:在PCR反应中加入适量的dUTP,以dUTP替代dTTP掺入DNA中,形成含dU碱基的PCR扩增产物;后续进行PCR反应时,使用UDG酶选择性切割可能被污染而带入的之前PCR扩增产生的含有dU的单链或双链DNA,从而避免之前的PCR扩增产物可能的污染对于本次PCR扩增带来的负面影响。
活性定义:One unit is defined as the amount of enzyme that catalyzes the release of 60 pmol of uracil per minute from double-stranded, uracilcontaining DNA. Activity is measured by release of [3H]-uracil in a 50 μl reaction containing 0.2 μg DNA (104–105 cpm/μg) in 30 minutes at 37℃.
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来源:大肠杆菌重组、表达和纯化而获得。
纯度:不含UDG酶活力之外的内切或外切脱氧核糖核酸酶、RNase和磷酸酶活性。
用途:防止PCR产物的交叉污染;单核苷酸多态性检测(single nucleotide polymorphism detection,GMPD);位点特异性突变;蛋白质与DNA相互作用研究;SNP基因分型;PCR产物的克隆;制备含有单链突出末端的PCR产物或cDNA。
酶储存溶液:10mM Tris-HCl (pH 7.4), 50mM KCl, 0.1mM EDTA, 1mM DTT, 0.1mg/ml BSA, 50% (v/v) glycerol。
10X E. coli UDG Buffer:200mM Tris-HCl, 10mM EDTA, 10mM DTT, pH 8.0 at 25℃。
失活或抑制:95℃加热10分钟可以使95% E. coli UDG失活。由于经95℃加热10分钟处理后,其仍保持部分活性,建议加入UDG抑制剂(如来自枯草芽孢杆菌噬菌体PBS2的Ugi蛋白或噬菌体phi29的p56蛋白)进一步抑制其酶活以免其继续降解含有dU的PCR产物。
保存条件:
-20℃保存,至少一年有效。
注意事项:E. coli UDG酶在大多数PCR反应缓冲液体系中均有活性,但对于自行使用的PCR或RT-PCR体系, 使用时建议先测试一下是否和所使用的体系兼容。通常取含dUTP的PCR扩增产物,参考图1加入适量UDG,观察能否有效降解含dUTP的PCR扩增产物。
E. coli UDG酶消化产生的DNA链的无碱基位点可通过加热,碱处理或核酸内切核酸酶处理而除去。通常PCR反应过程中的加热步骤可以确保UDG酶消化的位点被完全剪切开。
E. coli UDG酶在比较宽泛的pH范围内具有活性,其最适pH值为8.0,E. coli UDG酶活不需要二价阳离子,并被高离子强度(> 200 mM)所抑制。
E. coli UDG酶可以在PCR反应前清除不慎污染的含dUTP的PCR产物,从而避免由于污染导致的PCR假阳性结果。
E. coli UDG在加热变性后可能由于重折叠而在较低温度下表现出残留活性。因此,建议在退火步骤中使用55℃或更高的温度进行后续PCR。
E. coli UDG可以用于DNA或cDNA的常规PCR或qPCR扩增体系,但通常不建议用于RT-PCR体系。因为在反转录条件下,通常E. coli UDG会保持活性,并可能消化新合成的cDNA。
E. coli UDG酶经95℃加热10min处理后,仍会保持少量活性,如果希望用于RT-PCR体系,需要反转录和PCR分开进行,在反转录时不使用dUTP,在反转录后加入E. coli UDG酶处理,然后进行常规的PCR或qPCR,或者建议加入UDG抑制剂(如来自枯草芽孢杆菌噬菌体PBS2的Ugi蛋白或噬菌体phi29的p56蛋白)进一步抑制E. coli UDG的酶活性。
本产品 于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或 ,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。