AFDye 488是-种水溶性、强光稳定性的染料，具非常高的光量子产量。AFDye 488是-种发绿色荧光的染料，其激发光谱非常适合 于488nm激光谱线。在pH 4- 10范围内荧光不受pH影响。AFDye 488染料可偶联到各种抗体、多肽、蛋白、示踪剂和扩增底物，通常用于成像和流式分析中以生成稳定的荧光信号。

从化学角度来看，AF488是磺化罗丹明染料罗丹明110（R110）。与其他罗丹明类似，它可以作为5-和6-异构体，具有几乎相同的光物理性质。但是，异构体需要分离—否则，使用混合异构体染料可能会在标记产品的HPLC或电泳分离过程中导致双峰。本品为同分异构体纯5-AF488。

这种NHS酯是一种胺活性染料，它可以标记蛋白质、肽、氨基修饰低聚物和其他目标分子中的胺基。